この質問は通算100回以上は受けてますが、結論としては「どっちも大差無し」です。
いまどきナビだけで学生を大量集客するのって難しいんです。リーマンショック後の買い手市場のときは、ナビに掲載するだけでわんさか学生が集まりましたが今は全然違います。掲載社数でいっても当時の3倍以上も増えてますし、これからもどんどん増えていきます。超激戦です。
なので集客目的で大手ナビに掲載すると痛い目にあいます。学生さんや親御さんの信用獲得って感覚で掲載するのがいいかと思います。
※地方の会社さんだとマイナビ主催の合説に出ることが多いでしょうから、マイナビを選んだ方が合説セットで多少おトクになるかもしれません。まぁでもそれぐらいの違いです。